對使用后對弱極性色譜柱，沖洗保存*，使用緩沖系統的尤其要注意。推薦反相色譜系統的通用沖洗流程：

　　將所有通道置換成含有較低有機相比例的水相中，比如10-30%乙腈或甲醇，然后沖洗1個小時，然后再梯度增加有機相比例，各沖洗一定時間，終保留在高有機相比例的沖洗液里。低有機相比例的沖洗液是為了盡可能地沖洗緩沖鹽。通常低壓梯度洗脫的液相色譜儀采用的是四元泵，就是單泵四通道，比例閥混合。這種混合方式有個弊端，就是混合效果差，因為各通道不同比例是通過開關各通道閥的時間來控制的。往往是兩通道混合，就算沒有用緩沖鹽，還是建議先按比例混合好了，然后走單通道，否則的話一樣會造成鹽析出，或者基線波動。走梯度洗脫的話，往往會把有機相通道中加入一定比例的水，或者把水相通道配成梯度洗脫的初始比例，把有機相通道配成梯度洗脫終的比例。

　　這里有兩點需要說明：

　　1.一般認為，色譜系統包括弱極性色譜柱的沖洗甚至保存，都可以使用流動相，只是不加緩沖鹽、酸堿等。有一些品牌色譜柱，建議如果不是含鹽或者強酸強堿，一般不建議沖洗。不過這只適合短期保存，也就是沒隔多久又要再次使用。長期不用的色譜系統包括色譜柱還是應該沖洗后保存在高比例低極性溶劑體系中。一般建議正相系統保存在正已烷：異丙醇=90：10，反相系統保存在乙腈：水=90：10或者100%乙腈中。

　　2.隨著快速分離色譜柱的發展，很多的低粒徑色譜柱得到應用，而且往往柱溫也較高，通常達到50度或以上，這種色譜系統通常柱壓也較高，貿然用高比例水相沖洗可能會導致系統超壓。可以先用流動相沖洗，或者斷開色譜柱，用高比例水相沖洗系統，再接上柱子逐步提高有機相比例沖洗，也可以先調低流速沖洗。而且，待沖洗快要結束時再降低柱溫。